Skip to main content

2024 | OriginalPaper | Buchkapitel

Die Rolle der naturinspirierten Intelligenz bei der genomischen Diagnose antimikrobieller Resistenzen

verfasst von : Priyanka Sharma, Geetika Sethi, Manish Kumar Tripathi, Shweta Rana, Harpreet Singh, Punit Kaur

Erschienen in: Von der Natur inspirierte intelligente Datenverarbeitungstechniken in der Bioinformatik

Verlag: Springer Nature Singapore

Aktivieren Sie unsere intelligente Suche, um passende Fachinhalte oder Patente zu finden.

search-config
loading …

Zusammenfassung

Die aufkommende antimikrobielle Resistenz (AMR) gegenüber aktuellen antimikrobiellen Wirkstoffen ist das vordergründige öffentliche Gesundheitsproblem, das weiterhin Herausforderungen bei der Auswahl von Therapieschemata zur Behandlung von Infektionskrankheiten stellt. Die bakteriellen Krankheitserreger entwickeln AMR durch zwei Arten von Mechanismen, einer ist die intrinsische Resistenz aufgrund von Mutationen in chromosomalen Genen und der andere ist die extrinsische Resistenz durch den Erwerb von externen, plasmidvermittelten Genen. Der Schlüssel zur Diagnose von AMR liegt in der DNA-Sequenz von Bakterien, die die Resistenz verleihenden Mechanismen beherbergen. Die Fortschritte in der Technologie haben eine Fülle von Genomdaten generiert, die zur Identifizierung von diagnostischen Markern genutzt werden können. Darüber hinaus hat das maschinelle Lernen (ML) neue Möglichkeiten geschaffen, um Gesundheitsprobleme mit Hilfe von bioinformatischen Techniken signifikant zu lösen. In der letzten Dekade hat die naturinspirierte Intelligenz (NII) die Entwicklung von maschinellen Lernwerkzeugen zur Diagnose von antibakteriellen Resistenzgenmustern unterstützt. Die erfolgreiche Implementierung dieser Algorithmen, insbesondere bei komplexen und verwickelten Problemen, zeigt ihre Bedeutung in der künstlichen Intelligenz (KI). Diese Übersicht behandelt die Rolle der NII bei der Bekämpfung von Infektionskrankheiten mit Hilfe von Genomdaten sowie die zukünftige Perspektive ihrer Verwendung bei der Informationsverarbeitung, Entscheidungsfindung und Optimierung für die Diagnose von AMR. Die Schlüsselprobleme bei der praktischen Anwendung von NII mit Hilfe von genomischen Markern und mikrobiologischen Parametern werden ausführlich diskutiert. Dies wird dazu beitragen, die Lücke zwischen theoretischen Forschern, medizinischen Praktikern, Fachleuten und Ingenieuren, die an der Verwendung von NII zur Lösung von AMR interessiert sind, zu schließen.

Sie haben noch keine Lizenz? Dann Informieren Sie sich jetzt über unsere Produkte:

Springer Professional "Wirtschaft+Technik"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Wirtschaft+Technik" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 102.000 Bücher
  • über 537 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Automobil + Motoren
  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Elektrotechnik + Elektronik
  • Energie + Nachhaltigkeit
  • Finance + Banking
  • Management + Führung
  • Marketing + Vertrieb
  • Maschinenbau + Werkstoffe
  • Versicherung + Risiko

Jetzt Wissensvorsprung sichern!

Springer Professional "Technik"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Technik" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 67.000 Bücher
  • über 390 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Automobil + Motoren
  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Elektrotechnik + Elektronik
  • Energie + Nachhaltigkeit
  • Maschinenbau + Werkstoffe




 

Jetzt Wissensvorsprung sichern!

Springer Professional "Wirtschaft"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Wirtschaft" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 67.000 Bücher
  • über 340 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Finance + Banking
  • Management + Führung
  • Marketing + Vertrieb
  • Versicherung + Risiko




Jetzt Wissensvorsprung sichern!

Literatur
Zurück zum Zitat Aderhold A, Diwold K, Scheidler A, Middendorf M (2010) Artificial bee colony optimization: a new selection scheme and its performance BT. In: González JR, Pelta DA, Cruz C, Terrazas G, Krasnogor N (eds) Nature inspired cooperative strategies for optimization (NICSO 2010). Springer, Berlin Heidelberg, S 283–294. https://doi.org/10.1007/978-3-642-12538-6_24 Aderhold A, Diwold K, Scheidler A, Middendorf M (2010) Artificial bee colony optimization: a new selection scheme and its performance BT. In: González JR, Pelta DA, Cruz C, Terrazas G, Krasnogor N (eds) Nature inspired cooperative strategies for optimization (NICSO 2010). Springer, Berlin Heidelberg, S 283–294. https://​doi.​org/​10.​1007/​978-3-642-12538-6_​24
Zurück zum Zitat Agarwala R, Barrett T, Beck J, Benson DA, Bollin C, Bolton E, Bourexis D, Brister JR, Bryant SH, Canese K, Charowhas C, Clark K, DiCuccio M, Dondoshansky I, Feolo M, Funk K, Geer LY, Gorelenkov V, Hlavina W, … Zbicz,K (2017) Database resources of the national center for biotechnology information. Nucleic Acids Res 45(D1). https://doi.org/10.1093/nar/gkw1071 Agarwala R, Barrett T, Beck J, Benson DA, Bollin C, Bolton E, Bourexis D, Brister JR, Bryant SH, Canese K, Charowhas C, Clark K, DiCuccio M, Dondoshansky I, Feolo M, Funk K, Geer LY, Gorelenkov V, Hlavina W, … Zbicz,K (2017) Database resources of the national center for biotechnology information. Nucleic Acids Res 45(D1). https://​doi.​org/​10.​1093/​nar/​gkw1071
Zurück zum Zitat Alcock BP, Raphenya AR, Lau TTY, Tsang KK, Bouchard M, Edalatmand A, Huynh W, Nguyen ALV, Cheng AA, Liu S, Min SY, Miroshnichenko A, Tran HK, Werfalli RE, Nasir JA, Oloni M, Speicher DJ, Florescu A, Singh B, … McArthur AG (2020) CARD 2020: antibiotic resistome surveillance with the comprehensive antibiotic resistance database. Nucleic Acids Res 48(D1). https://doi.org/10.1093/nar/gkz935 Alcock BP, Raphenya AR, Lau TTY, Tsang KK, Bouchard M, Edalatmand A, Huynh W, Nguyen ALV, Cheng AA, Liu S, Min SY, Miroshnichenko A, Tran HK, Werfalli RE, Nasir JA, Oloni M, Speicher DJ, Florescu A, Singh B, … McArthur AG (2020) CARD 2020: antibiotic resistome surveillance with the comprehensive antibiotic resistance database. Nucleic Acids Res 48(D1). https://​doi.​org/​10.​1093/​nar/​gkz935
Zurück zum Zitat Allali I, Arnold JW, Roach J, Cadenas MB, Butz N, Hassan HM, Koci M, Ballou A, Mendoza M, Ali R, Azcarate-Peril MA (2017) A comparison of sequencing platforms and bioinformatics pipelines for compositional analysis of the gut microbiome. BMC Microbiology 17(1). https://doi.org/10.1186/s12866-017-1101-8 Allali I, Arnold JW, Roach J, Cadenas MB, Butz N, Hassan HM, Koci M, Ballou A, Mendoza M, Ali R, Azcarate-Peril MA (2017) A comparison of sequencing platforms and bioinformatics pipelines for compositional analysis of the gut microbiome. BMC Microbiology 17(1). https://​doi.​org/​10.​1186/​s12866-017-1101-8
Zurück zum Zitat Avershina E, Sharma P, Taxt AM, Singh H, Frye SA, Paul K, Kapil A, Naseer U, Kaur P, Ahmad R (2021) AMR-Diag: neural network based genotype-to-phenotype prediction of resistance towards β-lactams in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae. Comput Struct Biotechnol J, 19. https://doi.org/10.1016/j.csbj.2021.03.027 Avershina E, Sharma P, Taxt AM, Singh H, Frye SA, Paul K, Kapil A, Naseer U, Kaur P, Ahmad R (2021) AMR-Diag: neural network based genotype-to-phenotype prediction of resistance towards β-lactams in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae. Comput Struct Biotechnol J, 19. https://​doi.​org/​10.​1016/​j.​csbj.​2021.​03.​027
Zurück zum Zitat Bankevich A, Nurk S, Antipov D, Gurevich AA, Dvorkin M, Kulikov AS, Lesin VM, Nikolenko SI, Pham S, Prjibelski AD, Pyshkin AV, Sirotkin AV, Vyahhi N, Tesler G, Alekseyev MA, Pevzner PA (2012) SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing. J Comput Biol 19(5). https://doi.org/10.1089/cmb.2012.0021 Bankevich A, Nurk S, Antipov D, Gurevich AA, Dvorkin M, Kulikov AS, Lesin VM, Nikolenko SI, Pham S, Prjibelski AD, Pyshkin AV, Sirotkin AV, Vyahhi N, Tesler G, Alekseyev MA, Pevzner PA (2012) SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing. J Comput Biol 19(5). https://​doi.​org/​10.​1089/​cmb.​2012.​0021
Zurück zum Zitat Bortolaia V, Kaas RS, Ruppe E, Roberts MC, Schwarz S, Cattoir V, Philippon A, Allesoe RL, Rebelo AR, Florensa AF, Fagelhauer L, Chakraborty T, Neumann B, Werner G, Bender JK, Stingl K, Nguyen M, Coppens J, Xavier BB, … Aarestrup FM (2020) ResFinder 4.0 for predictions of phenotypes from genotypes. J Antimicrob Chemother 75(12). https://doi.org/10.1093/jac/dkaa345 Bortolaia V, Kaas RS, Ruppe E, Roberts MC, Schwarz S, Cattoir V, Philippon A, Allesoe RL, Rebelo AR, Florensa AF, Fagelhauer L, Chakraborty T, Neumann B, Werner G, Bender JK, Stingl K, Nguyen M, Coppens J, Xavier BB, … Aarestrup FM (2020) ResFinder 4.0 for predictions of phenotypes from genotypes. J Antimicrob Chemother 75(12). https://​doi.​org/​10.​1093/​jac/​dkaa345
Zurück zum Zitat Bradley P, Gordon NC, Walker TM, Dunn L, Heys S, Huang B, Earle S, Pankhurst LJ, Anson L, De Cesare M, Piazza P, Votintseva AA, Golubchik T, Wilson DJ, Wyllie DH, Diel R, Niemann S, Feuerriegel S, Kohl TA, … Iqbal Z (2015) Rapid antibiotic-resistance predictions from genome sequence data for Staphylococcus aureus and Mycobacterium tuberculosis. Nat Commun 6. https://doi.org/10.1038/ncomms10063 Bradley P, Gordon NC, Walker TM, Dunn L, Heys S, Huang B, Earle S, Pankhurst LJ, Anson L, De Cesare M, Piazza P, Votintseva AA, Golubchik T, Wilson DJ, Wyllie DH, Diel R, Niemann S, Feuerriegel S, Kohl TA, … Iqbal Z (2015) Rapid antibiotic-resistance predictions from genome sequence data for Staphylococcus aureus and Mycobacterium tuberculosis. Nat Commun 6. https://​doi.​org/​10.​1038/​ncomms10063
Zurück zum Zitat Brownlee J (2011) Clever algorithms: nature-inspired programming recipes. Jason Brownlee Brownlee J (2011) Clever algorithms: nature-inspired programming recipes. Jason Brownlee
Zurück zum Zitat Dahiya S, Sharma P, Kumari B, Pandey S, Malik R, Manral N, Veeraraghavan B, Pragasam AK, Ray P, Gautam V, Sistla S, Parija SC, Walia K, Ohri V, Das BK, Sood S, Kapil A (2017) Characterisation of antimicrobial resistance in Salmonellae during 2014–2015 from four centres across India: An ICMR antimicrobial resistance surveillance network report. Indian J Med Microbiol 35(1). https://doi.org/10.4103/ijmm.IJMM_16_382 Dahiya S, Sharma P, Kumari B, Pandey S, Malik R, Manral N, Veeraraghavan B, Pragasam AK, Ray P, Gautam V, Sistla S, Parija SC, Walia K, Ohri V, Das BK, Sood S, Kapil A (2017) Characterisation of antimicrobial resistance in Salmonellae during 2014–2015 from four centres across India: An ICMR antimicrobial resistance surveillance network report. Indian J Med Microbiol 35(1). https://​doi.​org/​10.​4103/​ijmm.​IJMM_​16_​382
Zurück zum Zitat Davis JJ, Boisvert S, Brettin T, Kenyon RW, Mao C, Olson R, Overbeek R, Santerre J, Shukla M, Wattam AR, Will R, Xia F, Stevens R (2016) Antimicrobial resistance prediction in PATRIC and RAST. Sci Rep 6. https://doi.org/10.1038/srep27930 Davis JJ, Boisvert S, Brettin T, Kenyon RW, Mao C, Olson R, Overbeek R, Santerre J, Shukla M, Wattam AR, Will R, Xia F, Stevens R (2016) Antimicrobial resistance prediction in PATRIC and RAST. Sci Rep 6. https://​doi.​org/​10.​1038/​srep27930
Zurück zum Zitat Feldgarden M, Brover V, Haft DH, Prasad AB, Slotta DJ, Tolstoy I, Tyson GH, Zhao S, Hsu C-H, McDermott PF, Tadesse DA, Morales C, Simmons M, Tillman G, Wasilenko J, Folster JP, Klimke W (2019) Using the NCBI AMRFinder tool to determine antimicrobial resistance genotype-phenotype correlations within a collection of NARMS isolates. BioRxiv, 550707. https://doi.org/10.1101/550707 Feldgarden M, Brover V, Haft DH, Prasad AB, Slotta DJ, Tolstoy I, Tyson GH, Zhao S, Hsu C-H, McDermott PF, Tadesse DA, Morales C, Simmons M, Tillman G, Wasilenko J, Folster JP, Klimke W (2019) Using the NCBI AMRFinder tool to determine antimicrobial resistance genotype-phenotype correlations within a collection of NARMS isolates. BioRxiv, 550707. https://​doi.​org/​10.​1101/​550707
Zurück zum Zitat Gelbukh A, Espinoza FC, Galicia-Haro SN (2014) Nature-inspired computation and machine learning. In: Lecture notes in computer science (including subseries lecture notes in artificial intelligence and lecture notes in bioinformatics), 8857(September). Gelbukh A, Espinoza FC, Galicia-Haro SN (2014) Nature-inspired computation and machine learning. In: Lecture notes in computer science (including subseries lecture notes in artificial intelligence and lecture notes in bioinformatics), 8857(September).
Zurück zum Zitat Joshi N, Srivastava SS (2011) Parallelization of Velvet, “a de novo genome sequence assembler”. Sci Technol Joshi N, Srivastava SS (2011) Parallelization of Velvet, “a de novo genome sequence assembler”. Sci Technol
Zurück zum Zitat Kaur A, Ruhela A, Sharma P, Khariwal H, Seth S, Kumar A, Kapil A, Elangovan R, Kalyanasundaram D (2019) Simultaneous and high sensitive detection of Salmonella typhi and Salmonella paratyphi a in human clinical blood samples using an affordable and portable device. Biomed Microdevices 21(4). https://doi.org/10.1007/s10544-019-0441-6 Kaur A, Ruhela A, Sharma P, Khariwal H, Seth S, Kumar A, Kapil A, Elangovan R, Kalyanasundaram D (2019) Simultaneous and high sensitive detection of Salmonella typhi and Salmonella paratyphi a in human clinical blood samples using an affordable and portable device. Biomed Microdevices 21(4). https://​doi.​org/​10.​1007/​s10544-019-0441-6
Zurück zum Zitat Kuroda M, Ohta T, Uchiyama I, Baba T, Yuzawa H, Kobayashi I, Cui L, Oguchi A, Aoki K, Nagai Y, Lian J, Ito T, Kanamori M, Matsumaru H, Maruyama A, Murakami H, Hosoyama A, Mizutani-Ui Y, Takahashi NK, … Hiramatsu K (2001) Whole genome sequencing of meticillin-resistant Staphylococcus aureus. Lancet (London, England) 357(9264):1225–1240. https://doi.org/10.1016/s0140-6736(00)04403-2 Kuroda M, Ohta T, Uchiyama I, Baba T, Yuzawa H, Kobayashi I, Cui L, Oguchi A, Aoki K, Nagai Y, Lian J, Ito T, Kanamori M, Matsumaru H, Maruyama A, Murakami H, Hosoyama A, Mizutani-Ui Y, Takahashi NK, … Hiramatsu K (2001) Whole genome sequencing of meticillin-resistant Staphylococcus aureus. Lancet (London, England) 357(9264):1225–1240. https://​doi.​org/​10.​1016/​s0140-6736(00)04403-2
Zurück zum Zitat Lee C-R, Lee JH, Park KS, Jeon JH, Kim YB, Cha C-J, Jeong BC, Lee SH (2017) Antimicrobial resistance of Hypervirulent Klebsiella pneumoniae: epidemiology, Hypervirulence-associated determinants, and resistance mechanisms. Front Cell Infect Microbiol 7:483. https://doi.org/10.3389/fcimb.2017.00483 Lee C-R, Lee JH, Park KS, Jeon JH, Kim YB, Cha C-J, Jeong BC, Lee SH (2017) Antimicrobial resistance of Hypervirulent Klebsiella pneumoniae: epidemiology, Hypervirulence-associated determinants, and resistance mechanisms. Front Cell Infect Microbiol 7:483. https://​doi.​org/​10.​3389/​fcimb.​2017.​00483
Zurück zum Zitat Leinonen R, Akhtar R, Birney E, Bower L, Cerdeno-Tárraga A, Cheng Y, Cleland I, Faruque N, Goodgame N, Gibson R, Hoad G, Jang M, Pakseresht N, Plaister S, Radhakrishnan R, Reddy K, Sobhany S, Hoopen PT, Vaughan R, … Cochrane G (2011) The European nucleotide archive. Nucleic Acids Res 39(SUPPL. 1). https://doi.org/10.1093/nar/gkq967 Leinonen R, Akhtar R, Birney E, Bower L, Cerdeno-Tárraga A, Cheng Y, Cleland I, Faruque N, Goodgame N, Gibson R, Hoad G, Jang M, Pakseresht N, Plaister S, Radhakrishnan R, Reddy K, Sobhany S, Hoopen PT, Vaughan R, … Cochrane G (2011) The European nucleotide archive. Nucleic Acids Res 39(SUPPL. 1). https://​doi.​org/​10.​1093/​nar/​gkq967
Zurück zum Zitat Li C, Chan F (2011) Complex-fuzzy adaptive image restoration—an artificial-bee-colony-based learning approach. In: Lecture notes in computer science (including subseries lecture notes in artificial intelligence and lecture notes in bioinformatics) 6592 LNAI (PART 2). https://doi.org/10.1007/978-3-642-20042-7_10 Li C, Chan F (2011) Complex-fuzzy adaptive image restoration—an artificial-bee-colony-based learning approach. In: Lecture notes in computer science (including subseries lecture notes in artificial intelligence and lecture notes in bioinformatics) 6592 LNAI (PART 2). https://​doi.​org/​10.​1007/​978-3-642-20042-7_​10
Zurück zum Zitat Liu Z, Deng D, Lu H, Sun J, Lv L, Li S, Peng G, Ma X, Li J, Li Z (2020) Evaluation of machine learning models for predicting antimicrobial resistance of Actinobacillus pleuropneumoniae from whole genome sequences. Front Microbiol 11:48 Liu Z, Deng D, Lu H, Sun J, Lv L, Li S, Peng G, Ma X, Li J, Li Z (2020) Evaluation of machine learning models for predicting antimicrobial resistance of Actinobacillus pleuropneumoniae from whole genome sequences. Front Microbiol 11:48
Zurück zum Zitat Lupolova N, Lycett SJ, Gally DL (2019) A guide to machine learning for bacterial host attribution using genome sequence data. Microb Genomics 5(12) Lupolova N, Lycett SJ, Gally DL (2019) A guide to machine learning for bacterial host attribution using genome sequence data. Microb Genomics 5(12)
Zurück zum Zitat Mahfouz N, Ferreira I, Beisken S, von Haeseler A, Posch AE (2020) Large-scale assessment of antimicrobial resistance marker databases for genetic phenotype prediction: a systematic review. J Antimicrob Chemother 75(11). https://doi.org/10.1093/jac/dkaa257 Mahfouz N, Ferreira I, Beisken S, von Haeseler A, Posch AE (2020) Large-scale assessment of antimicrobial resistance marker databases for genetic phenotype prediction: a systematic review. J Antimicrob Chemother 75(11). https://​doi.​org/​10.​1093/​jac/​dkaa257
Zurück zum Zitat Nguyen M, Long SW, McDermott PF, Olsen RJ, Olson R, Stevens RL, Tyson GH, Zhao S, Davis JJ (2019) Using machine learning to predict antimicrobial MICs and associated genomic features for nontyphoidal Salmonella. J Clin Microbiol 57(2):e01260-e1318 Nguyen M, Long SW, McDermott PF, Olsen RJ, Olson R, Stevens RL, Tyson GH, Zhao S, Davis JJ (2019) Using machine learning to predict antimicrobial MICs and associated genomic features for nontyphoidal Salmonella. J Clin Microbiol 57(2):e01260-e1318
Zurück zum Zitat O’neill J (2014) Antimicrobial resistance. Tackling a crisis for the health and wealth of nations O’neill J (2014) Antimicrobial resistance. Tackling a crisis for the health and wealth of nations
Zurück zum Zitat Overton K, Fortané N, Broom A, Raymond S, Gradmann C, Orubu ESF, Podolsky SH, Rogers Van Katwyk S, Zaman MH, Kirchhelle C (2021) Waves of attention: patterns and themes of international antimicrobial resistance reports, 1945–2020. BMJ Glob Health 6(11). https://doi.org/10.1136/bmjgh-2021-006909 Overton K, Fortané N, Broom A, Raymond S, Gradmann C, Orubu ESF, Podolsky SH, Rogers Van Katwyk S, Zaman MH, Kirchhelle C (2021) Waves of attention: patterns and themes of international antimicrobial resistance reports, 1945–2020. BMJ Glob Health 6(11). https://​doi.​org/​10.​1136/​bmjgh-2021-006909
Zurück zum Zitat Saltykova A, Mattheus W, Bertrand S, Roosens NHC, Marchal K, De Keersmaecker SCJ (2019) Detailed evaluation of data analysis tools for subtyping of bacterial isolates based on whole genome sequencing: Neisseria Meningitidis as a proof of concept. Front Microbiol 10. https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.02897 Saltykova A, Mattheus W, Bertrand S, Roosens NHC, Marchal K, De Keersmaecker SCJ (2019) Detailed evaluation of data analysis tools for subtyping of bacterial isolates based on whole genome sequencing: Neisseria Meningitidis as a proof of concept. Front Microbiol 10. https://​doi.​org/​10.​3389/​fmicb.​2019.​02897
Zurück zum Zitat Sequence read archive (2018) The sequence read archive (SRA) overview. NCBI Sequence read archive (2018) The sequence read archive (SRA) overview. NCBI
Zurück zum Zitat Sharma P, Dahiya S, Manral N, Kumari B, Kumar S, Pandey S, Sood S, Das B, Kapil A (2018) Changing trends of culture-positive typhoid fever and antimicrobial susceptibility in a tertiary care North Indian Hospital over the last decade. Indian J Med Microbiol 36(1). https://doi.org/10.4103/ijmm.IJMM_17_412 Sharma P, Dahiya S, Manral N, Kumari B, Kumar S, Pandey S, Sood S, Das B, Kapil A (2018) Changing trends of culture-positive typhoid fever and antimicrobial susceptibility in a tertiary care North Indian Hospital over the last decade. Indian J Med Microbiol 36(1). https://​doi.​org/​10.​4103/​ijmm.​IJMM_​17_​412
Zurück zum Zitat Tripathi MK, Sharma S, Singh TP, Ethayathulla AS, Kaur P (2021b) Computational intelligence in drug repurposing for COVID-19. In: Raza K (ed) Computational intelligence methods in COVID-19: surveillance, prevention, prediction and diagnosis. Springer, Singapore, pp 273–294. https://doi.org/10.1007/978-981-15-8534-0_14 Tripathi MK, Sharma S, Singh TP, Ethayathulla AS, Kaur P (2021b) Computational intelligence in drug repurposing for COVID-19. In: Raza K (ed) Computational intelligence methods in COVID-19: surveillance, prevention, prediction and diagnosis. Springer, Singapore, pp 273–294. https://​doi.​org/​10.​1007/​978-981-15-8534-0_​14
Zurück zum Zitat Tumbarello M, Trecarichi EM, De Rosa FG, Giannella M, Giacobbe DR, Bassetti M, Losito AR, Bartoletti M, Del Bono V, Corcione S, Maiuro G, Tedeschi S, Celani L, Cardellino CS, Spanu T, Marchese A, Ambretti S, Cauda R, Viscoli C, Viale P (2015) Infections caused by KPC-producing Klebsiella pneumoniae: differences in therapy and mortality in a multicentre study. J Antimicrob Chemother 70(7). https://doi.org/10.1093/jac/dkv086 Tumbarello M, Trecarichi EM, De Rosa FG, Giannella M, Giacobbe DR, Bassetti M, Losito AR, Bartoletti M, Del Bono V, Corcione S, Maiuro G, Tedeschi S, Celani L, Cardellino CS, Spanu T, Marchese A, Ambretti S, Cauda R, Viscoli C, Viale P (2015) Infections caused by KPC-producing Klebsiella pneumoniae: differences in therapy and mortality in a multicentre study. J Antimicrob Chemother 70(7). https://​doi.​org/​10.​1093/​jac/​dkv086
Zurück zum Zitat Zhang A-N, Gaston JM, Dai CL, Zhao S, Poyet M, Groussin M, Yin X, Li L-G, van Loosdrecht MCM, Topp E, Gillings MR, Hanage WP, Tiedje JM, Moniz K, Alm EJ, Zhang T (2021) An omics-based framework for assessing the health risk of antimicrobial resistance genes. Nat Commun 12(1):4765. https://doi.org/10.1038/s41467-021-25096-3 Zhang A-N, Gaston JM, Dai CL, Zhao S, Poyet M, Groussin M, Yin X, Li L-G, van Loosdrecht MCM, Topp E, Gillings MR, Hanage WP, Tiedje JM, Moniz K, Alm EJ, Zhang T (2021) An omics-based framework for assessing the health risk of antimicrobial resistance genes. Nat Commun 12(1):4765. https://​doi.​org/​10.​1038/​s41467-021-25096-3
Metadaten
Titel
Die Rolle der naturinspirierten Intelligenz bei der genomischen Diagnose antimikrobieller Resistenzen
verfasst von
Priyanka Sharma
Geetika Sethi
Manish Kumar Tripathi
Shweta Rana
Harpreet Singh
Punit Kaur
Copyright-Jahr
2024
Verlag
Springer Nature Singapore
DOI
https://doi.org/10.1007/978-981-99-7808-3_12

Premium Partner